一、蜂種不同

黑蜂蜂蜜是黑蜂采集花蜜釀制而成的，在我國主要有東北黑蜂和新疆黑蜂兩種，而普通蜂蜜是意蜂或中蜂釀制而成的，其中尤以意蜂釀制的意蜂蜜最為普遍，其實市場上絕大多數蜂蜜都是意蜂釀制的，中蜂蜜因產量稀缺且價格昂貴而很少在市場上售賣。

二、蜜源不同

黑蜂蜂蜜的蜜源比較復雜，東北黑蜂最著名的蜜源植物是椴樹(包括紫椴和糠椴)，新疆黑蜂的蜜源植物主要是益母草、野薄荷等山花，而普通蜂蜜的蜜源植物主要是油菜花、洋槐、棗樹等，另外蜂蜜因主要蜜源不同可分為椴樹蜜、槐花蜜、油菜花蜜等。

三、產地不同

黑蜂蜂蜜在我國主要產于新疆和黑龍江，其中東北黑蜂蜂蜜主要產于黑龍江的饒河縣及周邊地區，新疆黑蜂蜂蜜主要產于新疆的克斯縣、尼勒克縣、昭蘇縣等地，而普通蜂蜜的產地幾乎遍及全國各，從南到北、從東到西只要有養蜂的地方就有蜂蜜出產。

四、成分不同

黑蜂蜂蜜和普通蜂蜜的主要成分都是葡萄糖和果糖，尚含少量的蔗糖、氨基酸、維生素、礦物質及酶類等活性成分，區別在于不同蜂蜜中各種營養成分的含量有差異，其中最顯著的是葡萄糖和果糖的含量不同，但倘若是同一蜜源釀制的則基本沒有區別。

五、價格不同

黑蜂蜂蜜和普通蜂蜜在價格上沒有明顯的區別，但由于黑蜂蜂蜜的產量比普通蜂蜜要少得多，因此同等條件下黑蜂蜂蜜比普通蜂蜜要稍微貴一些，但有些品質優良的普通蜂蜜也可能比黑蜂蜂蜜貴，另外中蜂采集山野百花釀制的土蜂蜜一般比黑蜂蜂蜜貴。

總結：黑蜂蜂蜜是東北黑蜂或新疆黑蜂釀制的，而普通蜂蜜一般都是養殖規模最大的意蜂釀制的，兩種蜂蜜在本質上并沒有什么太大的區別，倘若是采集同一蜜源釀制的則幾乎沒有區別，因此在購買時完全沒有必要刻意去區別它們。